Holany

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Rédaction Newbi

Comparatifs et listesProfessions médicales
· mis à jour le 12 min de lecture

Logiciel de facturation profession libérale : top 5 comparé 2026

Comparatif des meilleurs logiciels de facturation pour professions libérales

Comparatif 2026 des solutions de facturation adaptées aux professions libérales.

Un logiciel de facturation pour profession libérale doit gérer le régime BNC, l'exonération de TVA des actes de soins, les notes d'honoraires et la facture électronique, dont la réception est obligatoire depuis septembre 2026 et l'émission en septembre 2027 pour les TPE. En 2026, cinq outils répondent à ces besoins : Newbi, Indy, Henrri, Freebe et Pennylane.

Que vous soyez médecin, infirmière, kinésithérapeute, architecte, consultant ou avocat, ce comparatif détaille pour chacun les fonctionnalités, les limites, le tarif et l'existence d'une version gratuite, avec un tableau récapitulatif et des conseils selon votre régime fiscal.

Ce qu'un professionnel libéral attend d'un logiciel de facturation

Avant de plonger dans le comparatif, rappelons les critères essentiels pour les professions libérales :

  • Compatibilité BNC : gestion de la déclaration 2035 et du livre-journal des recettes-dépenses.
  • Gestion de l'exonération de TVA : mention automatique de l'article 261-4-1 du CGI pour les professions médicales.
  • Notes d'honoraires : possibilité de générer des notes d'honoraires en plus des factures classiques, avec les mentions propres à chaque profession (barreau et numéro de toque sur une note d'honoraires d'avocat, par exemple).
  • Export comptable : formats compatibles avec les logiciels des AGA et experts-comptables (FEC, CSV, etc.).
  • Conformité e-facturation : réception obligatoire depuis le 1er septembre 2026, émission à partir du 1er septembre 2027 pour les TPE et micro-entreprises, avec le format Factur-X ou le raccordement à une PDP.

Les professions médicales et paramédicales (médecins, infirmiers, kinésithérapeutes, orthophonistes, etc.) bénéficient d'une exonération de TVA sur leurs actes de soins. Votre logiciel doit pouvoir appliquer automatiquement cette exonération et afficher la mention légale correspondante sur chaque facture. Pour les actes hors soins (expertises, formations), la TVA peut s'appliquer : vérifiez que l'outil gère les deux cas. Pour un cas concret, notre guide de la facture d'ostéopathe et de sa mention d'exonération montre comment rédiger une note d'honoraires conforme.


1. Newbi -- La solution tout-en-un pensée pour les libéraux

Newbi est une plateforme de facturation et de gestion complète, conçue dès le départ pour répondre aux besoins des indépendants, des TPE et des professions libérales. L'interface est moderne, intuitive, et l'ensemble des fonctionnalités est accessible sans formation technique. Le détail du module de facturation est présenté sur la page produit.

Fonctionnalités adaptées aux professions libérales

  • Facturation conforme avec mentions légales automatiques (exonération TVA, numéro ADELI, etc.)
  • Gestion des notes d'honoraires et des avoirs
  • Module CRM intégré pour le suivi client/patient
  • Connexion bancaire pour le rapprochement automatique des paiements
  • OCR intelligent pour la saisie automatique des justificatifs de dépenses
  • Export comptable compatible AGA et experts-comptables (format FEC)
  • Tableau de bord BNC avec suivi des recettes et des dépenses
  • Prêt pour la e-facturation (réforme 2026-2027)

Avantages

  • Interface claire et rapide, adaptée aux non-comptables
  • Toutes les fonctionnalités réunies dans un seul outil (facturation, CRM, banque, dépenses)
  • Support réactif et francophone
  • Tarification transparente et accessible

Limites

  • Moins connu que certains concurrents historiques
  • Fonctionnalités avancées de comptabilité pure (bilan, liasse fiscale) réservées aux experts-comptables partenaires

Tarif

À partir de 9 euros/mois pour les indépendants. Essai gratuit 30 jours sans carte bancaire.


2. Indy (ex Georges) -- Le spécialiste de la comptabilité BNC

Indy, anciennement connu sous le nom de Georges, s'est fait un nom auprès des professions libérales en BNC. L'outil mise sur l'automatisation de la comptabilité et la génération de la déclaration 2035.

Fonctionnalités adaptées aux professions libérales

  • Catégorisation automatique des transactions bancaires
  • Génération de la déclaration 2035 et télétransmission
  • Facturation intégrée avec gestion de la TVA
  • Rapprochement bancaire automatique
  • Collaboration avec l'AGA

Avantages

  • Excellente automatisation de la comptabilité BNC
  • Déclaration 2035 générée en quelques clics
  • Synchronisation bancaire performante

Limites

  • Module de facturation moins complet que des outils dédiés (pas de CRM, pas de kanban projet)
  • L'OCR pour les justificatifs est basique sur les formules d'entrée de gamme
  • Interface parfois dense pour les utilisateurs débutants
  • Pas de module e-facturation natif pour l'instant

Tarif

À partir de 22 euros/mois (formule Essentiel). Version gratuite très limitée disponible.


3. Henrri -- La facturation gratuite pour démarrer

Henrri, édité par Rivalis, propose un logiciel de facturation entièrement gratuit. C'est une option intéressante pour les professions libérales qui débutent et ont des besoins de facturation simples.

Fonctionnalités adaptées aux professions libérales

  • Création de devis et factures conformes
  • Gestion de l'exonération de TVA
  • Suivi des paiements
  • Export des données comptables (CSV)
  • Personnalisation des documents

Avantages

  • 100 % gratuit, sans limite de factures
  • Simple à prendre en main
  • Suffisant pour une activité libérale à faible volume de facturation

Limites

  • Aucune connexion bancaire
  • Pas d'OCR ni de gestion des dépenses
  • Pas de CRM ni de gestion de projet
  • Pas de module 2035 ni d'export FEC natif
  • Support limité (pas de téléphone)
  • Pas de préparation e-facturation

Tarif

Gratuit.


4. Freebe -- L'allié des micro-entrepreneurs libéraux

Freebe cible spécifiquement les micro-entrepreneurs et les freelances. L'outil offre un tableau de bord clair pour piloter son activité au quotidien, avec un suivi du chiffre d'affaires par rapport aux plafonds de la micro-entreprise.

Fonctionnalités adaptées aux professions libérales

  • Facturation conforme avec mentions obligatoires
  • Suivi du plafond de chiffre d'affaires micro-entreprise
  • Gestion de la TVA (franchise en base ou assujetti)
  • Suivi des cotisations URSSAF
  • Tableau de bord simplifié

Avantages

  • Conçu spécifiquement pour les micro-entrepreneurs
  • Suivi des seuils et des cotisations très pratique
  • Prix abordable

Limites

  • Non adapté au régime réel BNC (pas de 2035)
  • Pas de connexion bancaire ni d'OCR
  • CRM très basique
  • Limité dès que l'activité grandit ou passe en société
  • Pas de gestion e-facturation

Tarif

À partir de 4,90 euros/mois. Essai gratuit de 15 jours.


5. Pennylane -- La comptabilité connectée à la facturation

Pennylane est une plateforme de comptabilité collaborative qui intègre un module de facturation. L'outil est pensé pour le travail en binôme entre le dirigeant et son expert-comptable.

Fonctionnalités adaptées aux professions libérales

  • Facturation et devis conformes
  • Synchronisation bancaire multi-banques
  • OCR performant pour les justificatifs
  • Tableau de bord financier en temps réel
  • Collaboration directe avec l'expert-comptable
  • Export FEC et préparation de la 2035 (via l'expert-comptable)

Avantages

  • Outil très complet sur le volet comptable
  • Synchronisation bancaire parmi les meilleures du marché
  • OCR de qualité professionnelle
  • Bon écosystème d'intégrations

Limites

  • Nécessite obligatoirement de travailler avec un expert-comptable partenaire Pennylane
  • Tarification moins transparente (dépend du cabinet comptable)
  • Peut être surdimensionné pour une petite activité libérale
  • CRM et gestion commerciale limités

Tarif

À partir de 14 euros/mois HT (hors honoraires expert-comptable). Tarification sur devis selon les cabinets.


Tableau comparatif des 5 logiciels

Comparatif des fonctionnalités clés pour les professions libérales -- Février 2026
CritèreNewbiIndyHenrriFreebePennylane
Compatible BNCPartielMicro uniquement
Gestion exonération TVA
CRM intégréBasiqueNonBasiqueLimité
Connexion bancaireNonNon
OCR justificatifsLimitéNonNon
e-Facturation 2026-2027En coursNonNon
Export comptable (FEC)CSVNon
Prix (à partir de)9 euros/mois22 euros/moisGratuit4,90 euros/mois14 euros/mois HT

En profession libérale au régime BNC (Bénéfices Non Commerciaux), votre comptabilité repose sur les recettes encaissées et les dépenses décaissées, et non sur la facturation émise. Assurez-vous que votre logiciel distingue bien la date de facturation de la date d'encaissement. C'est cette dernière qui compte pour votre déclaration 2035. Un outil avec connexion bancaire simplifie considérablement ce suivi au quotidien.


Comment choisir le bon logiciel selon votre situation

Comment choisir un logiciel de facturation en profession libérale

Le bon choix dépend de votre régime fiscal, de votre volume de facturation et de vos besoins en gestion.

Le meilleur logiciel de facturation pour une profession libérale dépend avant tout de votre situation :

Vous êtes en micro-entreprise libérale

Si votre activité est simple avec peu de factures mensuelles, Freebe ou Henrri peuvent suffire. Freebe est particulièrement utile pour suivre vos seuils de chiffre d'affaires. Cependant, dès que vous avez besoin de connexion bancaire ou d'OCR, tournez-vous vers Newbi qui offre ces fonctionnalités à un tarif accessible.

Vous êtes au régime réel BNC (déclaration 2035)

C'est le cas le plus courant pour les professions libérales établies. Vous avez besoin d'un outil qui gère le livre des recettes-dépenses, l'export FEC et idéalement la préparation de la 2035. Newbi et Indy sont les mieux positionnés. Newbi offre l'avantage d'un outil tout-en-un (facturation + CRM + banque + dépenses), tandis qu'Indy se concentre sur l'automatisation comptable.

Vous travaillez déjà avec un expert-comptable

Si votre expert-comptable est partenaire Pennylane, cette solution peut être pertinente pour fluidifier votre collaboration. Sinon, tout logiciel proposant un export FEC propre fera l'affaire : c'est le cas de Newbi et d'Indy.


Les critères essentiels en résumé

Conformité légale : mentions obligatoires, numérotation, archivage
Gestion de l'exonération de TVA pour les actes médicaux et paramédicaux
Export comptable au format FEC pour votre AGA ou expert-comptable
Connexion bancaire pour automatiser le rapprochement des paiements
OCR pour numériser et classer vos justificatifs de dépenses sans ressaisie
Préparation à la e-facturation obligatoire dès 2026
Interface simple qui ne nécessite pas de compétences comptables avancées

Pour aller plus loin

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En résumé

Le marché des logiciels de facturation pour professions libérales est riche, mais tous les outils ne se valent pas. Henrri et Freebe conviennent aux activités simples ou aux débutants. Indy excelle sur l'automatisation comptable BNC. Pennylane s'adresse aux libéraux qui travaillent étroitement avec un expert-comptable partenaire.

Newbi se distingue comme la solution la plus complète et la plus équilibrée : facturation conforme, CRM, connexion bancaire, OCR, export FEC et préparation e-facturation, le tout dans une interface pensée pour les non-comptables. C'est l'outil idéal pour les professions libérales qui veulent gagner du temps sans sacrifier la rigueur comptable.


Questions fréquentes